Los ríos de Tayikistán son de pleno caudal y pertenecen principalmente a la cuenca del mar de Aral. Y solo unos pocos desembocan en las aguas del lago Karakul o el río Tarima.
Río Amu Darya
El canal del Amu Darya atraviesa el territorio de cuatro países a la vez: Afganistán, Tayikistán, Uzbekistán y Turkmenistán. La longitud total del canal es de 2.400 kilómetros. De estos, 1.415 kilómetros pasan por el país. La fuente del Amu Darya está formada por la confluencia de dos ríos: Vakhsh y Pyanj. La desembocadura del río son las aguas del Mar de Aral (en la confluencia forma un gran delta).
Hay pocos afluentes cerca del río. En promedio, el Amu Darya recibe las aguas de Kafirnigan, Surkhandarya y Sherebad, así como un afluente izquierdo: el río Kunduz. Y además, hasta el lugar de la confluencia, no hay más afluentes. Las aguas del río se utilizan activamente y, por lo tanto, el Amu Darya no llega al Mar de Aral. Esto es precisamente lo que se convirtió en una de las razones de su desecación.
En las aguas del Amu Darya, hay bastantes variedades diferentes de peces: áspid; hombre calvo; bagre aral; brema; pez sable; carpa plateada; Amur blanco; odio.
Río Vanj
Uno de los ríos, cuyo canal se encuentra exclusivamente en el territorio de Tayikistán. Es un afluente derecho del río Pyanj. La longitud total del río es de 103 kilómetros. La fuente está formada por la confluencia de dos ríos: uno desciende de los glaciares de la cresta Vanch, el otro de la cresta de la Academia de Ciencias (vertiente occidental). El canal discurre entre las crestas Vanch y Darvaz.
Río Kashkadarya
Territorialmente, el lecho del río atraviesa las tierras de Tayikistán (región de Sughd) y Uzbekistán (región de Kashkadarya). Convencionalmente, el río tiene tres nombres: en los tramos superiores: Obikhunda; el curso intermedio - Shinachasai; inferior - Maimanakadarya.
La longitud total del canal es de 378 kilómetros. El nacimiento del río se encuentra a una altitud de 2960 metros sobre el nivel del mar y está formado por dos ríos sin nombre. Afluentes principales: Akdarya (Aksu); Tanhidizadarya; Guzardarya.
Río muksu
La longitud total del canal es de 88 kilómetros. Muksu se encuentra en la región de Jirgatal de Tayikistán. La fuente es la confluencia de dos ríos: Seldara y Sauksoy (glaciares Fedchenko y Bolshoi Saukdar).
Río Kuzylsu
Kyzylsu, que significa "río rojo", atraviesa el territorio de Kirguistán y Tayikistán. La fuente son las laderas de la Cordillera Trans-Alai. La longitud total del canal es de 235 kilómetros. En la confluencia con el río Muksu, da lugar al río Vakhsh.
Río Vakhsh
La longitud total del canal del río es de 786 kilómetros y todos pasan por el territorio de Tayikistán. El nacimiento del río está en las laderas del Pamir, pero el lugar de su confluencia con las aguas del río Pyanj da lugar al gran Amu Darya. El río es la principal fuente de riego y generación de energía.